История развития школы-интерната № 5 начинается с 2006 года.
03.03.2006 – выделение из состава МСКОУ школы-интерната № 4 МОУ «Специальная (коррекционная) школа-интернат для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, с отклонениями в развитии» и передача его в ведомство УСЗН г. Магнитогорска.
Регистрация учреждения в ИФНС Правобережного района г. Магнитогорска.
16.01.2008 – получение лицензии на право осуществления образовательной деятельности.
23.06.2008 – получение свидетельства о государственной аккредитации учреждения.
15.06.2009 – переименование учреждения на основании Постановления Главы города Магнитогорска № 5332-П на Муниципальное специальное (коррекционное) образовательное учреждение для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, с ограниченными возможностями здоровья «Специальная (коррекционная) общеобразовательная школа-интернат№5 для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, с ограниченными возможностями здоровья» города Магнитогорска.
13.04.2010 – переименование учреждения на основании Постановления Главы города Магнитогорска № 3450-П на Муниципальное образовательное учреждение для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей «Специальная (коррекционная) школа-интернат № 5 для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, с ограниченными возможностями здоровья» города Магнитогорска.
14.09.2010 – получение лицензии на право осуществления медицинской деятельности.
Муниципальное общеобразовательное учреждение для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей «Специальная (коррекционная) школа-интернат № 5 для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, с ограниченными возможностями здоровья» города Магнитогорска за весь период имеет самостоятельный баланс, смету финансовых расходов, штатное расписание, гербовую печать, работает в режиме 6-дневной рабочей недели.
03.03.2021 учреждение отметило 15-летний юбилей со дня перехода в управление социальной защиты населения.